Динамика контаминации холерными вибрионами водных объектов окружающей среды г. Ростова-на-Дону и характеристика биологических свойств выделенных штаммов

Цель: ретроспективный анализ результатов мониторинговых исследований водных объектов окружающей среды (ООС) г. Ростова-на-Дону на наличие холерных вибрионов в период с 1989 г. по 2023 г. по стационарным точкам отбора проб, закреплённым за ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора, выявление тенденций и особенностей динамики выделения и биологических свойств изолированных штаммов. Материалы и методы: в период с 1989 по 2023 гг. были исследованы 4362 пробы из водных ООС. Организацию и проведение исследований осуществляли в соответствии с действующими нормативно-методическими документами. Секвенирование изолированных штаммов проводили на платформе MiSeq (Illumina). Результаты: за анализируемый период штаммы Vibrio cholerae обнаруживались во всех исследуемых водоемах г. Ростова-на-Дону (в реках Дон, Темерник и протоке Мертвый Донец) в основном в июле и августе. Из 122 выделенных штаммов восемь относились к эпидемически значимым (токсигенным) и 114 — к нетоксигенным. Наибольшее число штаммов было выделено в 2022 г. (21 штамм). Были обнаружены штаммы V. cholerae О1 (119 штаммов) и О139 (3) серогрупп, биовара классического и Эль Тор (сероваров Огава, Инаба и Гикошима). Выводы: сохраняются эпидемиологические риски завоза возбудителя холеры из эндемичных стран, а также из сопредельных стран в случаях осложнения там эпидситуации по этой инфекции. В поверхностных водоёмах г. Ростова-на-Дону имеются благоприятные условия для циркуляции холерных вибрионов и сохраняются риск распространения инфекции водным путём, в случае контаминации возбудителем холеры водных экосистем.

1. Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Монахова Е.В., и др. Эпидемиологическая ситуация по холере в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2024;(1):76-88. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-1-76-88

2. Москвитина Э.А., Янович Е.Г., Куриленко М.Л., Кругликов В.Д., Носков А.К. Эколого-эпидемиологические аспекты контаминации V. cholerae О1 водных объектов в Республике Калмыкия. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2021;1(12):79-86. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2021-29-12-79-86

3. Миронова Л.В., Бочалгин Н.О., Гладких А.С., Феранчук С.И., Пономарева А.С., Балахонов С.В. Филогенетическое положение и особенности структуры геномов ctxAB– tcpA+ Vibrio cholerae из поверхностных водоемов на неэндемичной по холере территории. Проблемы особо опасных инфекций. 2020;(1):115-123. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-1-115-123

4. Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., и др. Сравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в России и на эндемичных по холере территориях. Проблемы особо опасных инфекций. 2021;(3):72-82. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-3-72-82

5. Агафонова Е.Ю., Смирнова Н.И., Альхова Ж.В., Краснов Я.М., Ливанова Л.Ф., и др. Нетоксигенные штаммы Vibrio cholerae биовара Эль Тор, выделенные на территории России: молекулярно-генетические особенности и патогенные свойства. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2019;96(2):13-24. https://doi.org/10.36233/0372-9311-2019-2-13-24

6. Носков А.К., Кругликов В.Д., Лопатин А.А., Чемисова О.С., Левченко Д.А., и др. Результаты мониторинга холеры на административных территориях России в период с 2013 по 2019 год. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2021;98(2):163-175. https://doi.org/10.36233/0372-9311-56

7. Ежова М.И., Левченко Д.А., Архангельская И.В., Кругликов В.Д., Непомнящая Н.Б. Особенности биологических свойств Vibrio cholerae, изолированных в процессе мониторинга водных объектов Ростова-на-Дону с 1989 по 2018 год. Проблемы особо опасных инфекций. 2021;(1):148-151. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-1-148-151

8. Bankevich A, Nurk S, Antipov D, Gurevich AA, Dvorkin M, et al. SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol. 2012;19(5):455-477. https://doi.org/10.1089/cmb.2012.0021

9. Монахова Е.В., Ghosh А., Mutreja А., Weill F., Ramamurthy T. Эндемичная холера в Индии и завозная холера в России: что общего? Проблемы особо опасных инфекций. 2020;(3):17-26. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2020-3-17-26

10. Водопьянов С.О., Водопьянов А.С., Олейников И.П., Монахова Е.В. Разработка схемы типирования токсигенных холерных вибрионов на основе данных биоинформационного анализа. Здоровье населения и среда обитания – ЗНиСО. 2022;(7):66-71. https://doi.org/10.35627/2219-5238/2022-30-7-66-71